Zeki Sistemler Teori ve Uygulamaları Dergisi

Zeki Sistemler Teori ve Uygulamaları Dergisi

Convolutional Neural Network Approach to Predict Tumor Samples Using Gene Expression Data

Yazarlar: Büşra Nur DARENDELİ, Alper YILMAZ

Cilt 4 , Sayı 2 , 2021 , Sayfalar 136 - 141

Konular:Bilgisayar Bilimleri, Yapay Zeka

DOI:10.38016/jista.946954

Anahtar Kelimeler:TCGA,RNA-Seq,Cacer,CNN,Gene expression

Özet: Kanser her yıl milyonlarca insanı tehdit eden, erken teşhisi hala mümkün olmayan yaygın bir hastalıktır. Erken teşhis, kanserle baş etmenin ve ölüm oranını düşürmenin en önemli yollarından biridir. Derin öğrenme yaklaşımlarındaki gelişmeler ve biyolojik verilerdeki artış, kanserin teşhisini ve karakterizasyonunu kolaylaştırabilecek uygulamalar sunmaktadır. Bu çalışmada, gen ifade verilerini kullanarak derin öğrenme yaklaşımı ile kanser teşhisine yeni bir bakış açısı sağlamayı amaçladık. 30 farklı kanser çeşidine ait RNA-Seq verisi Kanser Genom Atlası (TCGA) adlı kaynaktan normal dokuların RNA-Seq verileri GTEx adlı kaynaktan temin edilip model eğitiminde kullanılmıştır. Gen ifade verileri RGB formatına dönüştürülüp Konvolusyonel Sinir Ağı (CNN) eğitimi için kullanıldı. Eğitilen model, gen ifade verilerine dayanarak kanseri %97 doğrulukla tahmin edebilmektedir. Sonuç olarak çalışmamız, derin öğrenme yaklaşımının ve biyolojik verilerin tümör örneklerinin tanısında büyük bir potansiyele sahip olduğunu göstermektedir.

ATIFLAR
Atıf Yapan Eserler
Sonuçların tamamını görmek için Asos İndeks'e üye bir üniversite ağından erişim sağlamalısınız. Kurumunuzun üye olması veya kurumunuza ücretsiz deneme erişimi sağlanması için Kütüphane ve Dokümantasyon Daire Başkanlığı ile iletişim kurabilirsiniz.
Dergi editörleri editör girişini kullanarak sisteme giriş yapabilirler. Editör girişi için tıklayınız.
KAYNAK GÖSTER
BibTex
KOPYALA
@article{2021, title={Convolutional Neural Network Approach to Predict Tumor Samples Using Gene Expression Data}, volume={4}, number={136–141}, publisher={Zeki Sistemler Teori ve Uygulamaları Dergisi}, author={Büşra Nur DARENDELİ,Alper YILMAZ}, year={2021} }
APA
KOPYALA
Büşra Nur DARENDELİ,Alper YILMAZ. (2021). Convolutional Neural Network Approach to Predict Tumor Samples Using Gene Expression Data (Vol. 4). Vol. 4. Zeki Sistemler Teori ve Uygulamaları Dergisi.
MLA
KOPYALA
Büşra Nur DARENDELİ,Alper YILMAZ. Convolutional Neural Network Approach to Predict Tumor Samples Using Gene Expression Data. no. 136–141, Zeki Sistemler Teori ve Uygulamaları Dergisi, 2021.
Atıf Görüntüle
PDF Görüntüle
Kaynak Görüntüle
Paylaş
Dergi Bilgileri