Veri Bilimi

Veri Bilimi

DNA Dizilerinin Graf Benzetim Yolu İle Karşılaştırılması

Yazarlar: Cantekin ÇELİKHASI, Ahmet SAYAR, Adem ULU

Cilt 1 , Sayı 1 , 2018 , Sayfalar 15 - 19

Konular:Mühendislik

Anahtar Kelimeler:Graf Benzerliği,LZ Sıkıştırma,Komşu Eşleşme,Kosinüs Benzerliği,DNA örüntü keşfi

Özet: Bu çalışmanın amacı farklı DNA örneklerindeki dizilimlerin benzerlik oranını hesaplamaktır. DNA verilerinin büyüklüklerinin getirdiği işlem hacmini kısaltmak ve performansı arttırmak için,DNA dizileri sıkıştırılıp motif çıkarımı yapıldı. Bunun için LZ Sıkıştırma algoritması kullanıldı. Elde edilen motiflerden her biri sadece bir graf düğümünü ifade ederken bu motiflerin sırası da düğümlerin komşuluklarını ifade edecek şekilde grafa dönüştürüldü. Her bir DNA’dan elde edilen graf, DNA’lardaki benzerliği bulabilmek için kullanıldı. Graflar üzerinden benzerlik oranını hesaplayan algoritmalardan, her iki Komşu Eşleşme ve Kosinüs Benzerliği metotlarını karşılaştırdık. Buna göre Kosinüs Benzerliği’nin Komşu Eşleşme’ye göre daha performanslı olduğunu gösterdik.

ATIFLAR
Atıf Yapan Eserler
Henüz Atıf Yapılmamıştır
KAYNAK GÖSTER
BibTex
KOPYALA
@article{2018, title={DNA Dizilerinin Graf Benzetim Yolu İle Karşılaştırılması}, volume={1}, number={1}, publisher={Veri Bilimi}, author={Cantekin ÇELİKHASI,Ahmet SAYAR,Adem ULU}, year={2018}, pages={15–19} }
APA
KOPYALA
Cantekin ÇELİKHASI,Ahmet SAYAR,Adem ULU. (2018). DNA Dizilerinin Graf Benzetim Yolu İle Karşılaştırılması (Vol. 1, pp. 15–19). Vol. 1, pp. 15–19. Veri Bilimi.
MLA
KOPYALA
Cantekin ÇELİKHASI,Ahmet SAYAR,Adem ULU. DNA Dizilerinin Graf Benzetim Yolu İle Karşılaştırılması. no. 1, Veri Bilimi, 2018, pp. 15–19.
Atıf Görüntüle
PDF Görüntüle
Kaynak Görüntüle
Paylaş
Dergi Bilgileri