Turkish Veterinary Journal

Yazarlar: Hakan IŞIDAN, Turhan TURAN, Mustafa Ozan ATASOY

Konular:Veteriner Hekimlik

Anahtar Kelimeler:Infeksiyöz pankreatik nekrozis virusu,Sekans analizi,Filogenetik analiz,Moleküler karakterizasyon,Tam genom

Özet: İnfeksiyöz Pankreatik Nekrozis Virusu (IPNV), Kuzey Amerika’da 1941 yılındaki ilk tespitinden bu yana uluslararası ticaretin bir sonucu olarak Türkiye de dahil olmak üzere birçok ülkede saptanmıştır. Kayda değer ekonomik kayıplar özellikle altı aylık yaştan küçük balıkların enfekte olmasıyla ortaya çıkmaktadır. Enfeksiyonu oluşturan ajan Birnaviridae ailesi içerisinde yer alan Aquabirnavirus genusuna yer almakta olup 60 nm çapında, ikozahedral simetrili, zarfsız kapside ve iki segmentli ve iki iplikli RNA genoma sahiptir. Segment A VP2, VP3, VP4 ve VP5 proteinlerini, segment B ise bir RNA-bağımlı RNA polimeraz enzimi olan VP1’i kodlamaktadır. Bu çalışmada altı farklı ilden 2004-2013 yılları arasında Türkiye’de toplam altı ilden (Düzce, Şanlıurfa, Tokat, K. Maraş, Trabzon ve Gaziantep) elde edilen IPNV izolatlarının tam genom dizililiminin saptanarak moleküler karakterizasyonunun yapılması amaçlanmıştır. Tam genomik verilerin filogenetik analizi seçilen altı izolatın segment A’ya göre genogrup 5’e, segment B’ye göre grup 1’e dâhil olduğunu ortaya çıkarmıştır. Ayrıca VP2 geninin çok değişken bölgesi üzerinde düşük virülense işaret eden mutasyonlar ve VP5 geni üzerinde nonsense nokta mutasyonlar saptanmıştır. Bu çalışmanın Türkiye’de farklı coğrafik alanlarında sirküle olan IPNV izolatlarının nitelendirilmesine yönelik önemli katkı sağlayabileceği düşünülmektedir.

---