Türk Tarım ve Doğa Bilimleri Dergisi

Yazarlar: Oğuz AĞYAR, Emin ÖZKÖSE, Mehmet Sait EKİNCİ, İsmail AKYOL

Konular:Fen

DOI:10.30910/turkjans.642421

Anahtar Kelimeler:Filogenetik,Genetik Çeşitlilik,Morkaraman (Ovis aries)

Özet: Bu çalışmada, Morkaraman koyunlarının (Ovis aries) filogenetik ilişkileri mitokondriyal DNA (mtDNA) 16S rRNA gen dizisi analizi ile gerçekleştirilmiştir. Evcil koyunlarda, 16S rRNA geni 1574 baz çifti (bç) uzunluğundadır. Çalışmamızda mtDNA 16S rRNA gen bölgesi hedeflenerek, Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi (NCBI) alınan örnek sekansla (NC_001941.1) tasarlanan primerler ile, 536 bç’lik sekans ürünleri elde edilmiştir. Elde edilen diziler için homoloji araştırması, NCBI'de BLAST kullanılarak yapılmıştır. Çalışma sonunda elde ettiğimiz 16S rRNA gen bölgesi dizi bilgileri GenBank veri tabanına sırası ile bu erişim numaralarıyla yer almaktadır; Sırasıyla KU686952.1, KU686953.1, KU686954.1, KU686955.1, KU686956.1, KU686957.1, KU686958.1, KU686959.1, KU686960.1, KU686961.1 ve KU686962.1. Morkaraman koyun örnekleri (n=11) üzerinde yapılan analizler sonunda, mtDNA 16S rRNA gen bölgesi sekanslarından nükleotit farklılıkları bakımından 10 polimorfik bölge ve 8 haplotip bölge tespit edilmiştir. Tüm dizilerin nükleotit kompozisyon ortalamaları % 32.1 Adenin (A), % 24.2 Timin (T), % 22.2 Sitosin (C) ve % 21.5 Guanin (G); G + C % 43.7 olarak bulundu. 16S rRNA gen dizileri, haplotip çeşitliliği (Hd) ve nükleotit çeşitliliğine (π) dayanan DNA polimorfizmi sırasıyla 0.9273 ± 0.00442 ve 0.00427 ± 0.00125 olarak bulunmuştur. Gen dizileri bilgisine dayanarak, koyunlarda, mtDNA haplotipleri, mtDNA polimorfizmi, haplotipleri arasındaki filogenetik ilişkiler ile belirlenen yerli ve yabancı koyun ırkları arasındaki filogenetik ilişkileri belirlenmiştir.

---