Etlik Veteriner Mikrobiyoloji Dergisi

Etlik Veteriner Mikrobiyoloji Dergisi

Yaygın Salmonella Serovarlarının Moleküler Tekniklerle Tiplendirilmesi

Yazarlar: Elçin GÜNAYDIN, Selahattin ŞEN, K. Serdar DİKER, Derya KARATAŞ YENİ, Özlem KARDOĞAN, H. Kaan MÜŞTAK, Özlem ŞAHAN

Cilt 28 , Sayı 2 , 2017 , Sayfalar 85 - 95

Konular:-

Anahtar Kelimeler:Salmonella serovarları,Multiplex-PZR

Özet: Bu çalışmanın amacı, Veteriner Kontrol Merkez Araştırma Enstitüsü (VKMAE), Bakteriyolojik Teşhis Laboratuvarı sorumluluğunda 2009-2011 yılları arasında Salmonella Prevalans çalışması kapsamında, Kauffmann-White serotiplendirme şeması ile tiplendirmesi yapılan toplam 907 Salmonella izolatının, serogrup Salmonella multiplex- PZR, Faz 1 Salmonella multiplex-PZR ve Faz 2 Salmonella multiplex-PZR kullanarak sahada yaygın olarak sirküle olan Salmonellla serovarları için dizayn edilen primerler ile maksimum 2-3 gün gibi kısa sürede, düşük maliyetle tiplendirmesini yapabilmektir. Bu çalışmayla, konvansiyonel yöntemle faz 1 ve faz 2 antijenlerinin eş zamanlı sergilenmemesi sonucunda ekstra laboratuvar iş yükü, olası çarpraz reaksiyonlar sebepli ekstra antiserum harcanması dolayısıyla yaşanılan zaman kaybı ve yüksek maliyetin üstesinden gelineceği öngörüldü. Ayrıca, 2 testin (multiplex-PZR ve konvansiyel serotiplendirme) örtüşmediği durumlar bakterilerin 6.5 kb operonunu inceleyen ribotiplendirme desteğiyle çözülmesi yoluna gidilmiştir. Çalışmada kullanılacak primerler ile 907 izolatın % 29.32’sinin (266 izolat; 15 farklı serovar) üç antijenik yapısı da tam olarak identifiye edilip, isimlendirilebilmiştir. İncelenen izolatların somatik, flagellar 1 ve flagellar 2 antijenlerinin sırasıyla; %54.56 (490), %90.95 (825) ve %78.94 (716)’ü tespit edilebilmiştir. İzolatlarınazından % 50’sinin tam olarak isimlendirilebileceği öngörülmüştür ancak Salmonella Infantis (S. Infantis) ve S. Mbandaka suşarında somatik antijeni amplifiye eden primer olmasına rağmen somatik antijen tespit edilememiştir. Bu suşlar ribotiplendirmeye alınmıştır. Konvansiyonel seroloji, multiplex-PZR ve ribotiplendirme değerlendirildiğinde; ribotiplendirme ve multiplex-PZR’ların gold standart metoda destek metodlar olarak kullanabileceği tespit edilmiştir. Özet olarak; çalışmada mevcut olan primerler sadece sahada yaygın olan serovarların somatik, faz 1 ve faz 2 antijenlerine spesifik oldukları için PZR tüm serovarları identifiye etmekte yetersiz kalmıştır. Sonuç olarak ucuz, hızlı ve duyarlı metot olan multiplex-PZR’ların belirli somatik, flagellar 1 ve 2 antijenlerinin tespitinde konvansiyonel serolojik yönteme destek olarak kullanılabileceği kanısına varılmıştır.


ATIFLAR
Atıf Yapan Eserler
Sonuçların tamamını görmek için Asos İndeks'e üye bir üniversite ağından erişim sağlamalısınız. Kurumunuzun üye olması veya kurumunuza ücretsiz deneme erişimi sağlanması için Kütüphane ve Dokümantasyon Daire Başkanlığı ile iletişim kurabilirsiniz.
Dergi editörleri editör girişini kullanarak sisteme giriş yapabilirler. Editör girişi için tıklayınız.

KAYNAK GÖSTER
BibTex
KOPYALA
@article{2017, title={Yaygın Salmonella Serovarlarının Moleküler Tekniklerle Tiplendirilmesi}, volume={28}, number={2}, publisher={Etlik Veteriner Mikrobiyoloji Dergisi}, author={Elçin GÜNAYDIN,Selahattin ŞEN,K. Serdar DİKER,Derya KARATAŞ YENİ,Özlem KARDOĞAN,H. Kaan MÜŞTAK,Özlem ŞAHAN}, year={2017}, pages={85–95} }
APA
KOPYALA
Elçin GÜNAYDIN,Selahattin ŞEN,K. Serdar DİKER,Derya KARATAŞ YENİ,Özlem KARDOĞAN,H. Kaan MÜŞTAK,Özlem ŞAHAN. (2017). Yaygın Salmonella Serovarlarının Moleküler Tekniklerle Tiplendirilmesi (Vol. 28, pp. 85–95). Vol. 28, pp. 85–95. Etlik Veteriner Mikrobiyoloji Dergisi.
MLA
KOPYALA
Elçin GÜNAYDIN,Selahattin ŞEN,K. Serdar DİKER,Derya KARATAŞ YENİ,Özlem KARDOĞAN,H. Kaan MÜŞTAK,Özlem ŞAHAN. Yaygın Salmonella Serovarlarının Moleküler Tekniklerle Tiplendirilmesi. no. 2, Etlik Veteriner Mikrobiyoloji Dergisi, 2017, pp. 85–95.